Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BGRLO75368 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BGRLO75368 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BGRLO75368 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BGRLO75368 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms