Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT3O75175 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT3O75175 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT3O75175 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms