Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD5O60279 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD5O60279 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD5O60279 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD5O60279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms