Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTIFO43310 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTIFO43310 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTIFO43310 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTIFO43310 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTIFO43310 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTIFO43310 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTIFO43310 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTIFO43310 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTIFO43310 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTIFO43310 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTIFO43310 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTIFO43310 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTIFO43310 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTIFO43310 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTIFO43310 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTIFO43310 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTIFO43310 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTIFO43310 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTIFO43310 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTIFO43310 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTIFO43310 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTIFO43310 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTIFO43310 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTIFO43310 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTIFO43310 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTIFO43310 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTIFO43310 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTIFO43310 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTIFO43310 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTIFO43310 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTIFO43310 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTIFO43310 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTIFO43310 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTIFO43310 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTIFO43310 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTIFO43310 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTIFO43310 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTIFO43310 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTIFO43310 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTIFO43310 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTIFO43310 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTIFO43310 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTIFO43310 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTIFO43310 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTIFO43310 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTIFO43310 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTIFO43310 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTIFO43310 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTIFO43310 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTIFO43310 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTIFO43310 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTIFO43310 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTIFO43310 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTIFO43310 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTIFO43310 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTIFO43310 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTIFO43310 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTIFO43310 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTIFO43310 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTIFO43310 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTIFO43310 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTIFO43310 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTIFO43310 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTIFO43310 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTIFO43310 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTIFO43310 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTIFO43310 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CTIFO43310 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTIFO43310 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTIFO43310 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTIFO43310 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTIFO43310 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTIFO43310 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTIFO43310 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTIFO43310 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTIFO43310 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTIFO43310 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTIFO43310 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTIFO43310 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTIFO43310 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTIFO43310 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTIFO43310 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTIFO43310 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTIFO43310 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTIFO43310 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTIFO43310 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTIFO43310 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTIFO43310 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTIFO43310 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTIFO43310 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTIFO43310 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTIFO43310 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTIFO43310 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTIFO43310 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTIFO43310 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTIFO43310 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTIFO43310 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTIFO43310 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTIFO43310 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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