Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRTM2O43300 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRTM2O43300 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRTM2O43300 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms