Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLXNB1O43157 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLXNB1O43157 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLXNB1O43157 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.8 ms