Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZZEF1O43149 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZZEF1O43149 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZZEF1O43149 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZZEF1O43149 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms