Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SGSM2O43147 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SGSM2O43147 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SGSM2O43147 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SGSM2O43147 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SGSM2O43147 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SGSM2O43147 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms