Protein–RNA interactions for Protein: O15318

POLR3G, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3GO15318 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3GO15318 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3GO15318 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3GO15318 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3GO15318 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3GO15318 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms