Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PFDN6O15212 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN6O15212 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFDN6O15212 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms