Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4O00268 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4O00268 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4O00268 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4O00268 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4O00268 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4O00268 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4O00268 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF4O00268 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF4O00268 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4O00268 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4O00268 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4O00268 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4O00268 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4O00268 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4O00268 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4O00268 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4O00268 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4O00268 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4O00268 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4O00268 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4O00268 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4O00268 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4O00268 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4O00268 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4O00268 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4O00268 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4O00268 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4O00268 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4O00268 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4O00268 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4O00268 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4O00268 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4O00268 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4O00268 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4O00268 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4O00268 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4O00268 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4O00268 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4O00268 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4O00268 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4O00268 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4O00268 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4O00268 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4O00268 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4O00268 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4O00268 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4O00268 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4O00268 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4O00268 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4O00268 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4O00268 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4O00268 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4O00268 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4O00268 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4O00268 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4O00268 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4O00268 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4O00268 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4O00268 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4O00268 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4O00268 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4O00268 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4O00268 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4O00268 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4O00268 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4O00268 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4O00268 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4O00268 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4O00268 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4O00268 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4O00268 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4O00268 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4O00268 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4O00268 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4O00268 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4O00268 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4O00268 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4O00268 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4O00268 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4O00268 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4O00268 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4O00268 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4O00268 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4O00268 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4O00268 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4O00268 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4O00268 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4O00268 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF4O00268 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF4O00268 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF4O00268 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF4O00268 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4O00268 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4O00268 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4O00268 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4O00268 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4O00268 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4O00268 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4O00268 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms