Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QKU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3QKU1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3QKU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3QKU1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3QKU1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3QKU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3QKU1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3QKU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
J3QKU1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QKU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QKU1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QKU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3QKU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3QKU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
J3QKU1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
J3QKU1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QKU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QKU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QKU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QKU1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QKU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QKU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QKU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QKU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QKU1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QKU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QKU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QKU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QKU1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QKU1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QKU1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QKU1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3QKU1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3QKU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QKU1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QKU1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QKU1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QKU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QKU1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QKU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
J3QKU1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
J3QKU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3QKU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3QKU1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
J3QKU1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
J3QKU1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3QKU1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3QKU1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QKU1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QKU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QKU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QKU1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QKU1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QKU1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QKU1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QKU1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QKU1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QKU1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QKU1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QKU1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QKU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QKU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QKU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QKU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QKU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QKU1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QKU1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QKU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QKU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QKU1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QKU1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QKU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QKU1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QKU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QKU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QKU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QKU1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QKU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QKU1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QKU1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QKU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QKU1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QKU1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QKU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QKU1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QKU1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QKU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QKU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QKU1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3QKU1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3QKU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3QKU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QKU1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms