Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3KRW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3KRW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3KRW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3KRW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3KRW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KRW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KRW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KRW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KRW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KRW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KRW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KRW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KRW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms