Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQF6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQF6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQF6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQF6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQF6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQF6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQF6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQF6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQF6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQF6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQF6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQF6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQF6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQF6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQF6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQF6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQF6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQF6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H3BQF6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQF6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQF6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQF6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQF6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQF6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQF6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQF6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQF6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQF6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQF6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQF6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQF6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
H3BQF6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
H3BQF6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQF6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQF6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQF6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQF6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQF6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQF6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQF6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQF6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQF6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQF6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQF6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQF6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQF6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQF6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQF6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQF6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQF6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQF6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQF6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQF6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQF6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQF6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQF6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQF6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQF6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQF6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQF6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQF6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQF6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQF6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQF6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQF6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQF6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQF6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQF6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQF6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQF6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQF6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQF6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQF6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQF6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQF6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQF6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQF6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQF6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQF6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQF6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BQF6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQF6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQF6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQF6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQF6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQF6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms