Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF3CLB5ME19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EIF3CLB5ME19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CLB5ME19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CLB5ME19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF3CLB5ME19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms