Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B2RBV5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B2RBV5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B2RBV5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B2RBV5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B2RBV5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B2RBV5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B2RBV5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B2RBV5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B2RBV5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B2RBV5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B2RBV5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B2RBV5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B2RBV5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B2RBV5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B2RBV5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B2RBV5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B2RBV5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B2RBV5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B2RBV5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B2RBV5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
B2RBV5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B2RBV5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B2RBV5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B2RBV5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B2RBV5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B2RBV5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B2RBV5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B2RBV5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B2RBV5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B2RBV5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B2RBV5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B2RBV5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B2RBV5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B2RBV5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B2RBV5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B2RBV5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B2RBV5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B2RBV5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
B2RBV5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B2RBV5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B2RBV5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B2RBV5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B2RBV5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B2RBV5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B2RBV5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B2RBV5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B2RBV5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B2RBV5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B2RBV5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B2RBV5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B2RBV5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B2RBV5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B2RBV5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B2RBV5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
B2RBV5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B2RBV5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B2RBV5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B2RBV5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B2RBV5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B2RBV5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B2RBV5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B2RBV5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B2RBV5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B2RBV5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B2RBV5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
B2RBV5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B2RBV5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B2RBV5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B2RBV5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B2RBV5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
B2RBV5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B2RBV5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B2RBV5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B2RBV5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B2RBV5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B2RBV5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B2RBV5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B2RBV5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B2RBV5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B2RBV5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B2RBV5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B2RBV5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B2RBV5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B2RBV5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
B2RBV5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
B2RBV5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B2RBV5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B2RBV5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B2RBV5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B2RBV5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B2RBV5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B2RBV5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B2RBV5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
B2RBV5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B2RBV5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B2RBV5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
B2RBV5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B2RBV5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B2RBV5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms