Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGLL3A8MV65 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGLL3A8MV65 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL3A8MV65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms