Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA3AA6NCI4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VWA3AA6NCI4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VWA3AA6NCI4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWA3AA6NCI4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms