Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3PXD2BA1X283 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3PXD2BA1X283 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3PXD2BA1X283 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3PXD2BA1X283 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms