Protein–RNA interactions for Protein: A1L4Q6

Putative uncharacterized protein FLJ41423, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1L4Q6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A1L4Q6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A1L4Q6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A1L4Q6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A1L4Q6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A1L4Q6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A1L4Q6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A1L4Q6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A1L4Q6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A1L4Q6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A1L4Q6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A1L4Q6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A1L4Q6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A1L4Q6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A1L4Q6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A1L4Q6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A1L4Q6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A1L4Q6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A1L4Q6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A1L4Q6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A1L4Q6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A1L4Q6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A1L4Q6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A1L4Q6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A1L4Q6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A1L4Q6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A1L4Q6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A1L4Q6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A1L4Q6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A1L4Q6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A1L4Q6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A1L4Q6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A1L4Q6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A1L4Q6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A1L4Q6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A1L4Q6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1L4Q6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1L4Q6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1L4Q6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A1L4Q6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A1L4Q6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A1L4Q6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A1L4Q6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1L4Q6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1L4Q6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1L4Q6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1L4Q6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1L4Q6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A1L4Q6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1L4Q6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1L4Q6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1L4Q6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1L4Q6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1L4Q6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1L4Q6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1L4Q6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A1L4Q6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1L4Q6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1L4Q6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A1L4Q6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1L4Q6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1L4Q6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1L4Q6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1L4Q6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1L4Q6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A1L4Q6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A1L4Q6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1L4Q6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1L4Q6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1L4Q6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1L4Q6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1L4Q6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1L4Q6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1L4Q6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1L4Q6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1L4Q6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1L4Q6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1L4Q6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1L4Q6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1L4Q6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1L4Q6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1L4Q6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1L4Q6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms