Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0J9YYE9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0J9YYE9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0J9YYE9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms