Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms