Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC24CP53992 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.2 ms