RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.61■■■□□ 2.97
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KCNQ1-201ENST00000155840 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.77■■■□□ 2.36
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KCNQ1-201ENST00000155840 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.94■■■□□ 2.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.9■■■□□ 2.22
KCNQ1-201ENST00000155840 HRCP23327 699 aa28.8■■■□□ 2.2
KCNQ1-201ENST00000155840 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.76■■■□□ 2.19
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KCNQ1-201ENST00000155840 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.59■■■□□ 2.01
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KCNQ1-201ENST00000155840 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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KCNQ1-201ENST00000155840 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.93■■□□□ 1.9
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KCNQ1-201ENST00000155840 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.78■■□□□ 1.88
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KCNQ1-201ENST00000155840 NEUROD1Q13562 356 aa26.73■■□□□ 1.87
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KCNQ1-201ENST00000155840 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.58■■□□□ 1.85
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KCNQ1-201ENST00000155840 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.49■■□□□ 1.83
KCNQ1-201ENST00000155840 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
KCNQ1-201ENST00000155840 WIZO95785 1651 aa26.36■■□□□ 1.81
KCNQ1-201ENST00000155840 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
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KCNQ1-201ENST00000155840 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
KCNQ1-201ENST00000155840 SOGA1O94964 1423 aa26.19■■□□□ 1.78
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.19■■□□□ 1.78
KCNQ1-201ENST00000155840 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.09■■□□□ 1.77
KCNQ1-201ENST00000155840 CEP162Q5TB80 1403 aa26.08■■□□□ 1.77
KCNQ1-201ENST00000155840 MIER1Q8N108 512 aa26.08■■□□□ 1.77
KCNQ1-201ENST00000155840 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.07■■□□□ 1.76
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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KCNQ1-201ENST00000155840 ITGAEP38570 1179 aa25.87■■□□□ 1.73
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KCNQ1-201ENST00000155840 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.72■■□□□ 1.71
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KCNQ1-201ENST00000155840 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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KCNQ1-201ENST00000155840 KCNH8Q96L42 1107 aa25.42■■□□□ 1.66
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KCNQ1-201ENST00000155840 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.24■■□□□ 1.63
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KCNQ1-201ENST00000155840 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNQ1-201ENST00000155840 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
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KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM52Q96A61 297 aa25.03■■□□□ 1.6
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KCNQ1-201ENST00000155840 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.8■■□□□ 1.56
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KCNQ1-201ENST00000155840 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.69■■□□□ 1.54
KCNQ1-201ENST00000155840 NEFLP07196 543 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-201ENST00000155840 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.63■■□□□ 1.53
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF27Q86VH2 1401 aa24.62■■□□□ 1.53
KCNQ1-201ENST00000155840 PRXQ9BXM0 1461 aa24.58■■□□□ 1.53
KCNQ1-201ENST00000155840 ANP32CO43423 234 aa24.57■■□□□ 1.52
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KCNQ1-201ENST00000155840 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.55■■□□□ 1.52
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