Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIAS3Q9Y6X2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIAS3Q9Y6X2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIAS3Q9Y6X2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIAS3Q9Y6X2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIAS3Q9Y6X2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIAS3Q9Y6X2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIAS3Q9Y6X2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIAS3Q9Y6X2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIAS3Q9Y6X2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIAS3Q9Y6X2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIAS3Q9Y6X2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms