Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPL42Q9Y6G3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL42Q9Y6G3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL42Q9Y6G3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL42Q9Y6G3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL42Q9Y6G3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms