Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX13Q9Y5W8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX13Q9Y5W8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX13Q9Y5W8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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