Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP24Q9UPU5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP24Q9UPU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP24Q9UPU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP24Q9UPU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms