Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX13Q9UN79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX13Q9UN79 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SOX13Q9UN79 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms