Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF19Q9UMS4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF19Q9UMS4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF19Q9UMS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF19Q9UMS4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms