Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI1Q9ULC6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI1Q9ULC6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PADI1Q9ULC6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI1Q9ULC6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI1Q9ULC6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms