Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
GJD2Q9UKL4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJD2Q9UKL4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD2Q9UKL4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD2Q9UKL4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD2Q9UKL4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms