Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA2Q9UJY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA2Q9UJY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA2Q9UJY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA2Q9UJY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA2Q9UJY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms