Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2IRD1Q9UHL9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IRD1Q9UHL9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms