Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3KQ9UBQ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3KQ9UBQ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3KQ9UBQ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms