Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDP2Q9P2J9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDP2Q9P2J9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDP2Q9P2J9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms