Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKIRAS1Q9NYS0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKIRAS1Q9NYS0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms