Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC52A3Q9NQ40 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A3Q9NQ40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC52A3Q9NQ40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A3Q9NQ40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms