Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCFQ9NPI8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCFQ9NPI8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCFQ9NPI8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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