Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARS2Q9NP81 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARS2Q9NP81 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SARS2Q9NP81 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SARS2Q9NP81 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms