Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA8Q9NP80 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PNPLA8Q9NP80 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNPLA8Q9NP80 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms