Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGAP3Q9NP61 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARFGAP3Q9NP61 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms