Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1BQ9H816 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCLRE1BQ9H816 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLRE1BQ9H816 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms