Protein–RNA interactions for Protein: Q9H307

PNN, Pinin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNNQ9H307 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PNNQ9H307 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PNNQ9H307 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PNNQ9H307 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PNNQ9H307 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PNNQ9H307 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PNNQ9H307 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PNNQ9H307 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PNNQ9H307 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PNNQ9H307 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PNNQ9H307 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PNNQ9H307 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PNNQ9H307 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PNNQ9H307 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PNNQ9H307 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PNNQ9H307 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PNNQ9H307 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PNNQ9H307 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PNNQ9H307 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PNNQ9H307 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PNNQ9H307 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PNNQ9H307 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PNNQ9H307 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PNNQ9H307 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PNNQ9H307 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PNNQ9H307 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PNNQ9H307 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PNNQ9H307 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PNNQ9H307 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PNNQ9H307 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PNNQ9H307 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PNNQ9H307 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PNNQ9H307 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PNNQ9H307 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PNNQ9H307 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PNNQ9H307 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PNNQ9H307 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms