Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM5Q9C035 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM5Q9C035 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM5Q9C035 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM5Q9C035 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms