Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPCDR1Q9BY65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPCDR1Q9BY65 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPCDR1Q9BY65 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPCDR1Q9BY65 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms