Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BRIP1Q9BX63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BRIP1Q9BX63 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BRIP1Q9BX63 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BRIP1Q9BX63 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BRIP1Q9BX63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BRIP1Q9BX63 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BRIP1Q9BX63 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BRIP1Q9BX63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRIP1Q9BX63 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BRIP1Q9BX63 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BRIP1Q9BX63 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
BRIP1Q9BX63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRIP1Q9BX63 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms