Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
SYCP2Q9BX26 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYCP2Q9BX26 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYCP2Q9BX26 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYCP2Q9BX26 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SYCP2Q9BX26 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SYCP2Q9BX26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYCP2Q9BX26 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.3 ms