Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POP1Q99575 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POP1Q99575 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POP1Q99575 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POP1Q99575 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POP1Q99575 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POP1Q99575 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POP1Q99575 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POP1Q99575 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POP1Q99575 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POP1Q99575 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POP1Q99575 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POP1Q99575 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POP1Q99575 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POP1Q99575 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POP1Q99575 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POP1Q99575 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POP1Q99575 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POP1Q99575 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POP1Q99575 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POP1Q99575 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POP1Q99575 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POP1Q99575 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POP1Q99575 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POP1Q99575 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POP1Q99575 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POP1Q99575 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POP1Q99575 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POP1Q99575 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POP1Q99575 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POP1Q99575 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POP1Q99575 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POP1Q99575 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POP1Q99575 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POP1Q99575 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POP1Q99575 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POP1Q99575 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POP1Q99575 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POP1Q99575 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POP1Q99575 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POP1Q99575 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POP1Q99575 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POP1Q99575 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POP1Q99575 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POP1Q99575 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POP1Q99575 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POP1Q99575 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POP1Q99575 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POP1Q99575 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POP1Q99575 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POP1Q99575 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POP1Q99575 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POP1Q99575 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POP1Q99575 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POP1Q99575 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POP1Q99575 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POP1Q99575 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POP1Q99575 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POP1Q99575 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POP1Q99575 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POP1Q99575 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POP1Q99575 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POP1Q99575 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POP1Q99575 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POP1Q99575 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POP1Q99575 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POP1Q99575 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POP1Q99575 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POP1Q99575 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POP1Q99575 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POP1Q99575 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POP1Q99575 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POP1Q99575 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POP1Q99575 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POP1Q99575 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
POP1Q99575 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POP1Q99575 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POP1Q99575 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POP1Q99575 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POP1Q99575 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POP1Q99575 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POP1Q99575 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POP1Q99575 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POP1Q99575 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POP1Q99575 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POP1Q99575 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POP1Q99575 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POP1Q99575 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POP1Q99575 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms