Protein–RNA interactions for Protein: Q96T83

SLC9A7, Sodium/hydrogen exchanger 7, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A7Q96T83 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC9A7Q96T83 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9A7Q96T83 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9A7Q96T83 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A7Q96T83 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A7Q96T83 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A7Q96T83 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A7Q96T83 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A7Q96T83 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A7Q96T83 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A7Q96T83 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9A7Q96T83 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms